เมื่อวันที่ 15 มีนาคม พ.ศ. 2543 มีประกาศสถาบันฯ เรื่อง การจัดตั้งส่วนราชการในสถาบันเทคโนโลยีปทุมวัน กำหนดให้ “คณะวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี” เป็นส่วนราชการในสถาบันเทคโนโลยีปทุมวัน แบ่งเป็น
- ภาควิชาเคมีอุตสาหกรรม
- ภาควิชาศึกษาทั่วไป
- ภาควิชาอาชีวะและเทคนิคศึกษา
เมื่อ พ.ศ. 2543 พัฒนาหลักสูตรและจัดการเรียนการสอนหลักสูตรวิทยาศาสตรบัณฑิต สาขาวิชาเคมีอุตสาหกรรม (หลักสูตรใหม่)
เมื่อวันที่ 14 พฤศจิกายน พ.ศ. 2549 รัฐมนตรีว่าการกระทรวงศึกษาธิการ ออกกฎกระทรวงให้จัดตั้งส่วนราชการในสถาบันเทคโนโลยีปทุมวัน แบ่งเป็น
- สำนักงานอธิการบดี
- คณะวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี
- คณะวิศวกรรมศาสตร์
- ศูนย์ภาษาและคอมพิวเตอร์
- สำนักวิจัยและบริการวิชาการ
เมื่อ พ.ศ. 2550 ปิดหลักสูตรวิทยาศาสตรบัณฑิต สาขาวิชาเคมีอุตสาหกรรม (หลักสูตรใหม่ 2549)
เมื่อวันที่ 23 ธันวาคม พ.ศ. 2550 ประกาศสถาบันเทคโนโลยีปทุมวัน เรื่อง แบ่งโครงสร้างการบริหารงานของคณะวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี เป็น
- สำนักงานคณบดี
- สาขาวิชาศึกษาทั่วไป
- สาขาวิชาเทคโนโลยีคอมพิวเตอร์
- สาขาวิชาวิทยาศาสตร์และคณิตศาสตร์
เมื่อ พ.ศ. 2551 พัฒนาหลักสูตรและจัดการเรียนการสอนหลักสูตรวิทยาศาสตรบัณฑิต สาขาวิชาเทคโนโลยีคอมพิวเตอร์ (หลักสูตรใหม่ พ.ศ. 2551)
เมื่อ พ.ศ. 2555 ปรับปรุงหลักสูตรวิทยาศาสตรบัณฑิต สาขาวิชาเทคโนโลยีคอมพิวเตอร์ (หลักสูตรใหม่ 2551) ให้เป็นไปตามประกาศกระทรวงศึกษาธิการ เรื่อง กรอบมาตรฐานคุณวุฒิระดับอุดมศึกษาแห่งชาติ พ.ศ. 2552 และเปลี่ยนชื่อสาขาวิชาใหม่ เป็น สาขาวิชาเทคโนโลยีสารสนเทศ และพร้อมกันนี้ได้พัฒนาหลักสูตรวิทยาศาสตรบัณฑิต สาขาวิชาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีสิ่งแวดล้อม (หลักสูตรใหม่ พ.ศ. 2555)
เมื่อ พ.ศ. 2560 ปรับปรุงหลักสูตรวิทยาศาสตรบัณฑิต สาขาวิชาเทคโนโลยีสารสนเทศและสาขาวิชาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีสิ่งแวดล้อม) ทั้งนี้เพื่อให้เป็นไปตามประกาศกระทรวงศึกษาธิการ เรื่อง กรอบมาตรฐานคุณวุฒิระดับอุดมศึกษาแห่งชาติ พ.ศ. 2552
เมื่อ พ.ศ. 2560 พัฒนาหลักสูตรระดับบัณฑิตศึกษา จำนวน 2 หลักสูตร คือ หลักสูตรวิทยาศาสตรมหาบัณฑิต สาขาวิชาเทคโนโลยีสิ่งแวดล้อมเพื่อการเกษตร และหลักสูตรปรัชญาดุษฎีบัณฑิต สาขาวิชาเทคโนโลยีสิ่งแวดล้อมเพื่อการเกษตร
เมื่อ พ.ศ. 2562 พัฒนาหลักสูตรหลักสูตรวิทยาศาสตรบัณฑิต สาขาวิชาเทคโนโลยีอุตสาหกรรม (หลักสูตรใหม่ พ.ศ. 2562)
เมื่อวันที่ 9 มีนาคม 2565 มีประกาศสถาบันฯ เรื่อง การแบ่งส่วนราชการภายในสถาบันเทคโนโลยีปทุมวัน พ.ศ.2565 ข้อ 4 ระบุไว้ว่า “คณะวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี”เป็นส่วนราชการในสถาบันเทคโนโลยีปทุมวัน มีฐานะเทียบเท่าคณะตามกฎกระทรวงศึกษาธิการ เรื่อง จัดตั้งส่วนราชการในสถาบันเทคโนโลยีปทุมวัน พ.ศ. 2549
เมื่อวันที่ 9 มีนาคม 2565 มีประกาศสถาบันฯ เรื่อง การแบ่งส่วนราชการภายในสถาบันเทคโนโลยีปทุมวัน พ.ศ.2565 ข้อ 6 ระบุไว้ว่า “สำนักงานคณบดี” มีฐานะเทียบเท่ากองตามประกาศกระทรวงศึกษาธิการ เรื่อง การแบ่งราชการในสถาบันเทคโนโลยีปทุมวัน พ.ศ. 2550
เมื่อวันที่ 9 มีนาคม 2565 มีประกาศสถาบันฯ เรื่อง การแบ่งส่วนราชการภายในสถาบันเทคโนโลยีปทุมวัน พ.ศ.2565 กำหนดให้โครงสร้างการบริหารงานของคณะวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี เป็นดังนี้
- สำนักงานคณบดีคณะวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี
- สาขาวิชาวิทยาศาสตร์สิ่งแวดล้อมและวิทยาศาสตร์ประยุกต์
- สาขาวิชาเทคโนโลยีอุตสาหกรรมและการจัดการนวัตกรรม
- สาขาวิชาวิศวกรรมซอฟต์แวร์และระบบสารสนเทศ
- สาขาวิชาสหวิทยาการ
เมื่อ พ.ศ. 2565 ปิดหลักสูตรวิทยาศาสตรบัณฑิต สาขาวิชาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีสิ่งแวดล้อม
เมื่อ พ.ศ. 2565 ปรับปรุงหลักสูตรวิทยาศาสตรบัณฑิต สาขาวิชาวิศวกรรมซอฟต์แวร์และระบบสารสนเทศ
เมื่อ พ.ศ. 2565 ปรับปรุงหลักสูตรวิทยาศาสตรมหาบัณฑิต สาขาวิชาเทคโนโลยีสิ่งแวดล้อมเพื่อการเกษตร และหลักสูตรปรัชญาดุษฎีบัณฑิต สาขาวิชาเทคโนโลยีสิ่งแวดล้อมเพื่อการเกษตร โดยเปลี่ยนชื่อสาขาวิชา เป็น สาขาวิชาเทคโนโลยีสิ่งแวดล้อมการเกษตร
เมื่อ พ.ศ. 2565 ปรับปรุงหลักสูตรวิทยาศาสตรมหาบัณฑิต สาขาวิชาเทคโนโลยีอุตสาหกรรมและการจัดการนวัตกรรม และหลักสูตรปรัชญาดุษฎีบัณฑิต สาขาวิชาเทคโนโลยีอุตสาหกรรมและการจัดการนวัตกรรม